Qiagen, 830018, coincidencia de análisis IPA NUL

Análisis IPA Coincidencia NUL

Características

- Análisis de datos de microarrays de expresión génica/miRNA/SNP
- Una comprensión más profunda de la metabolómica, la proteómica y los datos de RNAseq.
- Identificación de los reguladores upstream
- Conocimiento de las interacciones moleculares y químicas y los fenotipos celulares.
- Descubrimientos sobre los procesos patológicos

Detalles del producto

IPA es una aplicación web integral que permite el análisis, la integración y la comprensión de datos de expresión génica, microarrays de miRNA y SNP, así como experimentos de metabolómica, proteómica y RNAseq. IPA también se puede utilizar para el análisis de experimentos a pequeña escala que generan listas de genes y sustancias químicas. IPA permite la búsqueda de información específica sobre genes, proteínas, sustancias químicas y fármacos, así como la creación de modelos interactivos de sistemas experimentales. Las funciones de análisis y búsqueda de datos ayudan a comprender la importancia de los datos, dianas específicas o biomarcadores candidatos en el contexto de sistemas biológicos o químicos más amplios. El software está respaldado por la Base de Conocimiento Ingenuity, con hallazgos biológicos y químicos altamente estructurados y detallados. Obtenga más información sobre QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA).

Actuación

Una gran cantidad de capacidades de análisis en IPA

Análisis del partido

Amplíe el alcance de sus descubrimientos al evaluar su conjunto de datos en el contexto de más de 50 000 análisis de IPA. Analysis Match le ayuda automáticamente a descubrir otros análisis principales de IPA con resultados biológicos similares (o opuestos) a los suyos. Estas coincidencias pueden ayudarle a confirmar su interpretación de los resultados o proporcionar información inesperada sobre mecanismos biológicos subyacentes compartidos entre conjuntos de datos aparentemente no relacionados.

Análisis de redes causales

El Análisis de Redes Causales identifica exhaustivamente las moléculas que controlan la expresión génica en los conjuntos de datos. Más allá de las relaciones directas o de un solo salto entre el regulador y las moléculas diana en el conjunto de datos, el Análisis de Redes Causales descubre redes de reguladores que se conectan con las moléculas diana del conjunto de datos. Concéntrese en las redes de mayor relevancia puntuando las redes causales resultantes con respecto a las moléculas, enfermedades o funciones de interés.

Análisis comparativo

El Análisis Comparativo permite visualizar rápidamente las tendencias de la puntuación de la vía canónica en función de la dosis, el tiempo u otros factores mediante el mapa de calor del Análisis Comparativo. Priorice por puntuación, grupo jerárquico o tendencia.

Bioperfilador

Una enfermedad o fenotipo puede perfilarse rápidamente mediante la comprensión de sus genes y compuestos asociados. Identifique genes con relevancia causal como posibles dianas o identifique dianas de toxicidad, fármacos conocidos asociados, biomarcadores y vías.

Análisis del regulador upstream

Este análisis predice moléculas ascendentes, incluidos miRNA y factores de transcripción, que pueden estar causando los cambios observados en la expresión genética.

Redes mecanicistas

Las redes mecanicistas generan automáticamente cascadas de señalización plausibles, que describen mecanismos de acción potenciales que conducen a cambios observados en la expresión genética.

Análisis de efectos posteriores

Los resultados de la expresión genética se utilizan para identificar si los procesos biológicos posteriores significativos aumentan o disminuyen.

Análisis de rutas, rutas canónicas, rutas superpuestas, importación de rutas y puntuación

Estos análisis se utilizan para determinar las vías más significativamente afectadas.

El análisis comparativo determina las vías más significativas, los reguladores ascendentes, las enfermedades, las funciones biológicas y más, en distintos puntos de tiempo, dosis u otras condiciones.

Análisis de red

Construya y explore redes transcripcionales, redes de dianas de miARN-ARNm, cascadas de fosforilación y redes de interacción proteína-proteína o proteína-ADN. Identifique los eventos reguladores que conducen desde eventos de señalización hasta efectos transcripcionales. Comprenda las respuestas a la toxicidad explorando las conexiones entre fármacos o dianas y genes o sustancias químicas relacionadas. Edite y amplíe las redes según las relaciones moleculares más relevantes para el proyecto.

Efectos del regulador

Proporciona información sobre sus datos al integrar los resultados del regulador ascendente con los resultados de los efectos descendentes para crear hipótesis causales que expliquen lo que puede estar ocurriendo ascendentemente para causar resultados fenotípicos o funcionales particulares descendentemente.

Análisis de fosforilación

Los cambios en los estados de fosforilación de las proteínas constituyen un importante mecanismo regulador en las células de mamíferos. Descubra los reguladores previos y los reguladores maestros de la red causal que podrían estar impulsando los cambios en los niveles de fosforilación de las proteínas en su conjunto de datos de fosfoproteómica. Visualice cómo las proteínas fosforiladas afectan las vías de señalización canónica. Estos resultados proporcionan hipótesis comprobables al identificar posibles cascadas de señalización a partir de los patrones de fosforilación en su conjunto de datos.

IsoProfiler

IsoProfiler le ayuda a identificar y priorizar isoformas con propiedades biológicas interesantes y relevantes para su investigación. Encuentre genes con transcripciones de ARN con patrones de expresión inusuales, como el cambio de isoformas, o con enfermedades o funciones conocidas. O utilice los datos de expresión humana GTEx totalmente integrados para identificar transcripciones con expresión tisular específica conocida. Visualice la expresión a nivel de isoforma en uno o varios conjuntos de datos.

Filtro objetivo de microARN

Este filtro reduce la cantidad de pasos necesarios para identificar dianas de ARNm con seguridad, rapidez y facilidad, permitiendo el examen de emparejamientos miARN-ARNm, la exploración del contexto biológico relacionado y el filtrado basado en información biológica relevante, así como en la información de expresión. El Filtro de Dianas de microARN proporciona información sobre los efectos biológicos de los miARN mediante interacciones validadas experimentalmente de TarBase y miRecords, así como interacciones miARN-ARNm predichas por TargetScan. Además, Ingenuity IPA incluye una gran cantidad de hallazgos relacionados con los miARN procedentes de la literatura revisada por pares.

Listas de toxicidad y funciones de toxicidad

Las funciones de toxicidad y las listas de toxicidad vinculan los datos experimentales con los puntos finales de la patología clínica, permiten comprender la respuesta farmacológica y respaldan la generación de hipótesis sobre el mecanismo de acción y el mecanismo de toxicidad.

Predictor de actividad molecular (MAP)

MAP permite la interrogación de subredes y vías canónicas y la generación de hipótesis seleccionando una molécula de interés, indicando la regulación positiva o negativa y simulando las consecuencias direccionales de las moléculas aguas abajo y la actividad inferida aguas arriba en la red o vía.

Vista de isoformas

Utilizando la vista de isoformas, se aclaran las implicaciones biológicas de los datos de RNAseq de alto rendimiento. Se pueden identificar las isoformas significativamente reguladas en su experimento y determinar su posible impacto utilizando información sobre dominios funcionales de proteínas y literatura específica sobre isoformas.

Gene y ChemView

Las capacidades de búsqueda y exploración en Ingenuity IPA brindan acceso a los hallazgos más actuales sobre genes, medicamentos, sustancias químicas, familias de proteínas, procesos celulares y patológicos normales, y vías de señalización y metabólicas.

Filtro de biomarcadores

Este filtro identifica rápidamente los mejores candidatos a biomarcadores en función de las características biológicas más relevantes para el estudio de descubrimiento.

Diseñador de rutas

Path Designer transforma redes y vías en gráficos de vías con calidad de publicación, ricos en color, texto y fuentes personalizados, iconos biológicos, orgánulos y fondos personalizados. Expande y explora vías con el contenido de alta calidad almacenado en Ingenuity IPA.

Principio

Conocimiento de bases de datos sin igual

Aplicaciones

- Transcriptómica
- Descubrimiento de biomarcadores
- Investigación de miRNA
- Toxicogenómica
- Metabolómica
- Reposicionamiento de fármacos
- Proteómica
- Análisis de redes causales