Qiagen, 9002035, Plataforma Rotor-Gene Q MDx (EE. UU.)

Ciclador de PCR en tiempo real con 6 canales (los canales rojo y HRM no están diseñados para usarse con pruebas de ácido nucleico aprobadas o autorizadas por la FDA), computadora portátil, software, accesorios, garantía de 1 año en piezas y mano de obra.

Características

- Ensayo aprobado por la FDA para la detección confiable de la mutación D842V en el gen PDGFRA
- Sistema listo para usar con flujo de trabajo sencillo y resultados al día siguiente
- Análisis de datos automatizado mediante el software Rotor-Gene AssayManager

Detalles del producto

El kit therascreen PDGFRA RGQ PCR es un ensayo de diagnóstico in vitro cualitativo en tiempo real para la detección de la mutación somática D842V en el gen PDGFRA utilizando ADN genómico extraído de tejido tumoral fijado con formalina e incluido en parafina (FFPE) de pacientes con tumor del estroma gastrointestinal (GIST).

El kit therascreen PDGFRA RGQ PCR está diseñado para ayudar a los médicos a identificar pacientes con GIST que podrían ser elegibles para el tratamiento con AYVAKIT (avapritinib) basándose en un resultado de detección de mutación en PDGFRA. Las muestras tumorales FFPE se procesan utilizando el kit de tejido QIAamp DSP DNA FFPE para la preparación manual de muestras y el instrumento Rotor-Gene Q MDx (US) para la amplificación y detección automatizadas.

Actuación

Medida de acuerdo: Porcentaje de acuerdo de frecuencias
Porcentaje general de acuerdo: 145/147
Porcentaje de acuerdo positivo: 40/42
Porcentaje de acuerdo negativo: 105/105

Medida de acuerdo: Porcentaje de acuerdo de frecuencias
Porcentaje general de acuerdo: 145/154
Porcentaje positivo de acuerdo: 40/43
Porcentaje negativo de acuerdo: 105/111

- Una mutación D842V en PDGFRA;
- Progresaron después del tratamiento con imatinib y al menos otro inhibidor de la quinasa, y no se sabe que tengan una mutación D842V en PDGFRA; o
- Intolerancia al imatinib progresada o experimentada, incluso en el entorno adyuvante, y que no habían recibido terapia adicional con inhibidores de la quinasa y no tenían una mutación D842V conocida en PDGFRA.

Estudio clínico que respalda el uso de AYVAKIT (avapritinib)

La eficacia del tratamiento con AYVAKIT (avapritinib) cuando su uso se valida con el kit therascreen PDGFRA RGQ PCR, se demuestra en los datos recogidos en el estudio BLU-285-1101 de AYVAKIT (avapritinib), reanalizados en el estudio puente.

El estudio clínico BLU-285-1101 fue un estudio abierto, multicéntrico, internacional, de fase 1, primero en humanos (FIH), para evaluar la seguridad y eficacia de AYVAKIT (avapritinib) en pacientes adultos con TEGI irresecable o metastásico. El estudio se amplió para incluir pacientes con TEGI avanzado, basándose en la alentadora eficacia inicial observada en el aumento de dosis. Se incluyó a un total de 237 pacientes, con o sin mutación en el gen PDGFRA, en todas las fases del estudio. De ellos, 204 recibieron al menos una dosis diaria de 300 mg o 400 mg de AYVAKYT (avapritinib) (33 pacientes recibieron una dosis <300 mg diaria). Los criterios de valoración principales fueron determinar la dosis máxima tolerada (MTD) y la dosis recomendada de fase 2 (RP2D) de AYVAKIT (avapritinib), determinar la seguridad y tolerabilidad generales de AYVAKIT (avapritinib) y determinar la tasa de respuesta general (ORR) mediante criterios de evaluación de respuesta modificados en tumores sólidos (mRECIST) versión 1.1 en la MTD/RP2D de AYVAKIT (avapritinib) en pacientes con GIST:

El análisis de la eficacia de AYVAKIT (avapritinib) se basó en los criterios de valoración principales de eficacia de supervivencia general (SG) en 40 pacientes evaluables en el punto de corte de la base de datos.

Entre los 31 pacientes en el grupo de dosis inicial de 300/400 mg que tenían mutaciones PDGFRA D842V identificadas por el ensayo QIAGEN CTA, 29 tuvieron una respuesta completa (CR) o una respuesta parcial (PR) confirmada según la revisión de radiología central para una ORR del 94% (IC del 95%: 78,6%, 99,2%). La mejor respuesta para estos 31 pacientes fue CR en dos pacientes, PR en 27 pacientes y enfermedad estable (SD) en dos pacientes, para una tasa de beneficio clínico (CBR) del 100%. La mediana de duración de la respuesta (DOR) no se alcanzó en el grupo de dosis de 300/400 mg; 22 pacientes (76%) fueron censurados en el momento del corte de datos según las reglas de censura de la FDA, con un 64% y un 51% estimados en respuesta a los 12 y 18 meses, respectivamente.

El estudio BLU-285-1101 cumplió su objetivo principal: demostrar que el tratamiento con AYVAKIT (avapritinib) proporciona un beneficio clínico significativo a los pacientes con GIST con mutación PDGFRA D842V, medido por la TRO. En conjunto, los resultados de eficacia y seguridad del estudio BLU-285-1101 demuestran que AYVAKIT (avapritinib) presenta un perfil beneficio-riesgo favorable y es un tratamiento útil en pacientes con GIST con mutación PDGFRA D842V.

Concordancia entre el ensayo CDx y el CTA (estudio puente)

En el estudio BLU-285-1101, el estado de mutación PDGFRA D842V para la detección y el reclutamiento de pacientes se determinó mediante un ensayo clínico (CTA).

Se evaluó la concordancia entre el kit therascreen PDGFRA RGQ PCR (CDx) y el CTA en ADN extraído de muestras de GIST de 154 pacientes en el estudio BLU-285-1101.

De las 154 muestras, 147 arrojaron un resultado válido con el kit therascreen PDGFRA RGQ PCR (pacientes evaluables para CDx). La PPA, la NPA y la OPA estimadas entre el kit therascreen PDGFRA RGQ PCR y la angiografía computarizada (con angiografía computarizada como método de referencia) para pacientes evaluables para CDx se detallan en la Tabla 1. El 98,64 % de las OPA cumplieron los criterios de aceptación del estudio (≥80 %).

* CTA como método de referencia y pacientes evaluables por CDx.

† Binomio Clopper-Pearson (Exacto).

Los siete sujetos con resultados no válidos del kit therascreen PDGFRA RGQ PCR se incluyeron como resultados discordantes en el análisis de todos los pacientes con CDx. Las estimaciones de PPA, NPA y OPA entre el kit therascreen PDGFRA RGQ PCR y el CTA (con el CTA como método de referencia) para todos los pacientes con CDx se detallan en la Tabla 2. El resultado de OPA del 94,16 % cumplió con los criterios de aceptación del estudio de ≥80 %.

* CTA como método de referencia y pacientes testables mediante CDx.

El kit therascreen PDGFRA RGQ PCR demostró una concordancia general del 98,64 % (IC del 95 %: 95,17; 99,83) en pacientes evaluables por CDx. El tratamiento con AYVAKIT (avapritinib) proporciona un beneficio clínico significativo a los pacientes con GIST con mutación PDGFRA D842V, medido mediante la TRO. La TRO para pacientes con mutación PDGFRA D842V positiva al utilizar el kit therascreen PDGFRA RGQ PCR fue de 0,94 (IC del 95 %: 0,79; 0,99), lo que corresponde al 94 %.

Principio

El kit therascreen PDGFRA RGQ PCR consta de una reacción de amplificación por PCR multiplex para detectar la mutación puntual de interés y una región de control aguas abajo de esta en el mismo gen PDGFRA.

El ensayo contiene los reactivos necesarios para la amplificación y detección de la secuencia de ADN diana mediante PCR cualitativa en tiempo real. Está diseñado para usarse con el instrumento Rotor-Gene Q MDx (US) junto con el software Rotor-Gene AssayManager.

El ensayo incluye varios controles que se utilizarán en cada ejecución. Se utilizará un control sin molde (NTC) para detectar cualquier contaminación. Se utilizará un plásmido de control positivo con las secuencias de interés para garantizar que la ejecución de la PCR se haya realizado dentro de los parámetros esperados.

El software Rotor-Gene AssayManager genera un valor Ct para la secuencia D842V y la secuencia de control presentes en una muestra. El software utiliza la diferencia de Ct (ΔCt) entre el valor Ct de D842V y el valor Ct del control para generar una llamada de mutación («Mutación D842V detectada» o «Sin mutación detectada» si la mutación D842V está presente o ausente).

Procedimiento

El flujo de trabajo de prueba, sencillo y directo, comienza con la extracción de ADN de tejido tumoral del estroma gastrointestinal FFPE mediante el kit QIAamp DSP DNA FFPE Tissue. A continuación, se realiza una PCR sensible en tiempo real en el instrumento Rotor-Gene Q MDx (US). Finalmente, el software Rotor-Gene AssayManager procesa y reporta los resultados con rapidez y precisión, informando al operador del sistema sobre la presencia o ausencia de la mutación D842V.

Aplicaciones

Instrucciones de uso del kit therascreen PDGFRA RGQ PCR (Manual). Enero de 2023.

El kit therascreen PDGFRA RGQ PCR es un ensayo de diagnóstico in vitro cualitativo en tiempo real para la detección de la mutación somática D842V en el gen PDGFRA utilizando ADN genómico extraído de tejido tumoral del estroma gastrointestinal (GIST) FFPE.

El kit therascreen PDGFRA RGQ PCR está diseñado para ayudar a los médicos a identificar pacientes con GIST que pueden ser elegibles para el tratamiento con AYVAKIT (avapritinib) según un resultado detectado de mutación PDGFRA.