Qiagen, 954414, Kit EZ1&2 DNA FFPE UNG (48)

Para 48 preparaciones: uracil-N-glicosilasa, cartucho FFPE de ADN EZ1 y 2, puntas de filtro y portapuntas desechables, tubos, solución de eliminación de parafina, proteinasa K, ARNasa A, agua sin ARNasa y tampones.

Características

- Alta recuperación de ADN amplificable
- Eliminación de parafina sin xileno ni disolventes similares
- Opción para eliminar artefactos de uracilo (citosina desaminada)
- ADN listo para usar para PCR, PCR digital (dPCR) y secuenciación de próxima generación (NGS)
- Pasos de pretratamiento de calentamiento y pipeteo de reactivos automatizados, disponibles en EZ2 Connect

Detalles del producto

Purifique grandes cantidades de ADN amplificable a partir de tejido fijado en formalina e incluido en parafina (FFPE) difícil de lisar. El protocolo EZ1&2 DNA FFPE utiliza doble lisis para recuperar el ADN eficazmente, mientras que el paso opcional con uracil-N-glicosilasa (UNG) elimina los artefactos de citosina desaminada para limitar el riesgo de errores de lectura de nucleótidos.

Los protocolos EZ1&2 DNA FFPE se pueden automatizar tanto en EZ1 Advanced XL como en EZ2 Connect.

El EZ2 Connect ofrece protocolos sin tarjeta, aplicaciones ampliadas y opciones de conectividad remota. Haga clic aquí para obtener más información sobre el EZ2 Connect o contacte a su representante de ventas para descubrir lo fácil que es obtener un EZ2 Connect para su laboratorio.

Actuación

En análisis UV-vis, fluorométrico y qPCR, la mayoría de las muestras procesadas con el kit EZ1&2 DNA FFPE mostraron una mayor abundancia de dsDNA (ver figura “Optimizado para el rendimiento de PCR”).

Para el análisis NGS, el kit EZ1&2 DNA FFPE UNG reduce significativamente las transiciones artificiales C→T/G→A, que suelen producirse en el material FFPE debido a la desaminación de la citosina (véase “Transiciones artificiales C→T/G→A”). Esto ayuda a prevenir falsos positivos de variantes de un solo nucleótido (SNV) en NGS (véase la figura “Reducción de las transiciones artificiales C→T | G→A”).

Principio

El kit EZ1&2 DNA FFPE maximiza la producción de ADN a partir de un número limitado de muestras de dos maneras: mediante un procedimiento de lisis en dos pasos, garantiza una alta extracción de ADN incluso en muestras difíciles de lisar. Además, su técnica de desparafinación sin disolventes y sin lavados minimiza el riesgo de pérdida de muestra, algo difícil de evitar con los métodos de desparafinación con disolventes y múltiples lavados.

La eliminación de enlaces cruzados aumenta aún más la cantidad de ADN amplificable recuperado (véase la figura "Optimizado para el rendimiento de PCR"). Además, hace que el ADN recuperado sea especialmente adecuado para el análisis NGS (véase la figura "Resultados fiables de dPCR y NGS").

Procedimiento

El kit EZ1&2 DNA FFPE automatiza completamente los pasos de unión, lavado y elución en el EZ1 Advanced XL o el EZ2 Connect. Los pasos de preparación (es decir, las digestiones con proteinasa K, la eliminación de enlaces cruzados y la digestión con ARNasa A) se realizan manualmente en el EZ1 Advanced XL; en el EZ2 Connect, muchos de estos pasos de preparación se pueden automatizar (véase la figura "Flujo de trabajo del EZ1&2 DNA FFPE").

Aplicaciones

El ADN aislado con el kit EZ1&2 DNA FFPE puede usarse inmediatamente para PCR, dPCR o NGS. También puede almacenarse entre -30 y -15 °C.