Qiagen, V16000213, Kit ForenSeq Signature Plus (96)

Incluye todos los reactivos necesarios para preparar bibliotecas de secuenciación a partir de muestras de ADN forense; parte de la solución de genómica forense MiSeq FGx

Características

- Interrogar 200 marcadores genéticos utilizando un único flujo de trabajo optimizado
- Placa UDI para una transferencia más fácil o automatizada
- La capacidad de multiplexación aumenta aún más la eficiencia operativa
- Análisis superior de muestras desafiantes y severamente degradadas

Detalles del producto

Genere perfiles de ADN más completos para hasta 96 muestras de ADN con menos de 2 horas de práctica gracias a nuestro sencillo flujo de trabajo basado en placas. El kit ForenSeq Signature Plus es la nueva generación del kit ForenSeq DNA Signature Prep e incorpora un nuevo control de amplificación positivo y una placa UDI. El resto de los componentes del kit se mantienen sin cambios. El kit ForenSeq DNA Signature Prep fue el primer método químico de secuenciación de repeticiones cortas en tándem (STR) basado en secuenciación de nueva generación (NGS) aprobado para su carga en el Sistema Nacional de Índices de ADN (NDIS) para el análisis de casos. El kit ForenSeq DNA Signature Prep se retirará debido a la escasez de material de control de amplificación positivo.

El kit ForenSeq Signature Plus combina más de 200 marcadores, incluyendo SNP autosómicos, STR de X e Y, que informan sobre identidad, fenotipo y ascendencia biogeográfica, en un flujo de trabajo único y optimizado, eliminando la necesidad de realizar múltiples pruebas de STR. Este flujo de trabajo integrado y sencillo maximiza la eficiencia del laboratorio al simplificar los programas de capacitación, los procedimientos de validación, las pruebas de competencia y otras medidas de control de calidad requeridas por los programas externos de certificación y acreditación. La solución es retrocompatible con la actual identificación de alelos CE.

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Actuación

Característica: Número de marcadores
STR de autosomas globales: 27
Y-STR: 24
X-STR: 7
SNP de identidad: 94
SNP fenotípicos: 22
SNP de ascendencia biogeográfica: 56

Característica: Detalles
Tipos de muestra: ADNg, hisopos bucales, tarjeta FTA
Ingesta recomendada de ADNg humano por muestra: 1 ng
Entrada recomendada para perforación de tarjetas FTA por muestra: 1,2 mm
Capacidad de multiplexación por ejecución: 8–96 muestras
Detección de amplicones cortos: ≥65 pb
Multiplexación de locus: análisis simultáneo de unos 200 marcadores genéticos
Tiempo total de preparación en la biblioteca: 7 horas y 15 minutos
Tiempo de práctica: 1 hora y 45 minutos
Tiempo total de secuenciación: aproximadamente 28 horas con el kit de reactivos MiSeq FGx; aproximadamente 22 horas con el kit de reactivos MiSeq FGx Micro

- Elimina la necesidad de múltiples kits STR
- La gama más amplia de SNP proporciona información que no está disponible con otras tecnologías
- Obtenga datos altamente discriminantes de menos de 100 pg de ADN degradado o complejo
- Prepare hasta 96 bibliotecas simultáneamente utilizando una placa UDI y un formato simple basado en placa

- Mezcla de cebadores de ADN A: contiene pares de cebadores para 58 STR (incluidos 27 STR autosómicos, 7 marcadores de haplotipo X y 24 Y) y 94 iiSNP
- Mezcla de cebadores de ADN B: contiene todos los marcadores de la mezcla de cebadores de ADN A, además de pares de cebadores para 56 aiSNP biogeográficos y 22 piSNP (2 aiSNP también se utilizan para la estimación del fenotipo)

El kit ForenSeq Signature Plus forma parte de una solución integral de secuenciación masiva paralela, diseñada específicamente para aplicaciones de genómica forense. El kit ForenSeq Signature Plus permite a su laboratorio preparar hasta 96 muestras de ADN para la secuenciación de nueva generación (NGS) de Illumina con un sencillo flujo de trabajo basado en placas.

El kit ForenSeq Signature Plus consolida todos los marcadores autosómicos de repetición corta en tándem (STR) que se utilizan actualmente en todo el mundo para el análisis de casos y la creación de bases de datos de ADN criminal en un único flujo de trabajo optimizado, eliminando la necesidad de realizar múltiples pruebas de STR. Además de los STR autosómicos, X e Y, el kit ForenSeq Signature Plus ofrece conjuntos de marcadores que no suelen estar disponibles con los métodos tradicionales de electroforesis capilar (CE). Estos incluyen un conjunto denso de polimorfismos de un solo nucleótido que informan sobre la identidad (iiSNP) y que son útiles para la atribución de la fuente, SNP que informan sobre el fenotipo (piSNP) que proporcionan estimaciones del color de los ojos (azul, intermedio, castaño) y del color del cabello (castaño, pelirrojo, negro, rubio), y SNP que informan sobre la ascendencia biogeográfica (aiSNP). Estos pueden ser cruciales para generar pistas de investigación a partir de casos sin sospechosos que, de otro modo, podrían haberse quedado en el olvido.

Loci forenses cubiertos con el kit ForenSeq Signature Plus

En una sola reacción, la Mezcla de Cebadores A (DPMA) permite analizar todos los STR diana autosómicos, de los cromosomas X e Y, y el conjunto completo de iiSNP. La Mezcla de Cebadores B (DPMB) incluye los aiSNP y piSNP.

El kit ForenSeq Signature Plus incluye:

La mayoría de los SNP incluidos en el kit ForenSeq Signature Plus contienen tamaños de amplicón ≤125 pb, lo que los hace ideales para el análisis de ADN degradado o incluso de extractos de ADN altamente inhibidos. El kit ForenSeq Signature Plus también ofrece una mayor capacidad para detectar componentes minoritarios de bajo nivel en mezclas que, de otro modo, podrían pasar desapercibidos con el análisis convencional de STR y CE. Esta mayor potencia se debe a la gran cantidad de marcadores incluidos en el kit, muchos de los cuales son altamente polimórficos, junto con la sensibilidad inherente del instrumento MiSeq FGx.

Especificaciones del kit ForenSeq Signature Plus

Principio

El kit ForenSeq Signature Plus forma parte de una solución integral, desde la muestra hasta la respuesta, que incluye la preparación de bibliotecas, una plataforma de secuenciación de ADN y un software de análisis de datos diseñado específicamente para la genómica forense. Con cerca de 200 marcadores genéticos en un único flujo de trabajo, la solución MiSeq FGx ofrece el multiplexado más completo de STR y SNP, y la vía más sencilla para la identificación humana.

Procedimiento

El kit ForenSeq Signature Plus incluye todos los reactivos necesarios para preparar bibliotecas de ADN para secuenciación, incluyendo reactivos de PCR, placa UDI y microesferas de purificación y normalización. Analice simultáneamente los marcadores que elija en una sola amplificación. Elija entre el conjunto de cebadores de ADN A (DPMA) o el conjunto de cebadores de ADN B (DPMB) para consolidar varios kits de electroforesis capilar (EC) existentes.

Aplicaciones

El kit ForenSeq Signature Plus es parte de la solución de genómica forense ForenSeq MiSeq FGx, un flujo de trabajo de ADN a datos completo y totalmente validado, diseñado específicamente para aplicaciones de genómica forense.