Thermo Fisher, 550494, Matriz de genotipado de maíz Axiom™

Matriz de genotipado de maíz Axiom™ La matriz de genotipado de maíz Axiom fue diseñada por AgroClustER Synbreed (financiada por el Ministerio de Educación e Investigación de Alemania, BMBF) a través de una colaboración liderada por la profesora Chris-Carolin Schön, la Dra. Eva Bauer y Sandra Unterseer (Technische Universität München, Alemania), y el Dr. Georg Haberer y Michael Seidel (Helmholtz Zentrum München, Alemania) a través del programa Affymetrix Expert Design.* La matriz interroga a 616.201 variantes polimórficas cuidadosamente seleccionadas para representar la diversidad global en el genoma del maíz.
El array supera los desafíos específicos causados ​​por un alto contenido de elementos repetitivos, una alta diversidad genómica y estructural, y un bajo desequilibrio de ligamiento (LD) en diferentes cultivares. Los SNP del array se descubrieron inicialmente mediante resecuenciación en un panel de 30 líneas endogámicas que representaban la diversidad global. El array se validó utilizando un conjunto diverso de líneas europeas, estadounidenses y tropicales/semitropicales de diversos acervos genéticos de Dent y Flint.
Características de la matriz de genotipado de maíz Axiom:
•Contenido completo: 616 201 variantes, incluidas 609 442 SNP y 6759 pequeñas variantes de inserción/deleción. Aplicaciones de la matriz de genotipado de maíz Axiom:
•Investigación de rasgos complejos-Análisis de diversidad genética-Mapeo de asociaciones-Análisis y selección de todo el genoma-Estructura de haplotipos en variedades de maíz-Análisis de LD-Mapeo de QTL
Mejoramiento molecular - Desarrollo de nuevas líneas endogámicas - Selección genómica *Las matrices de diseño experto son diseñadas por líderes de opinión clave en la comunidad de genómica vegetal y animal y se ponen a disposición del público con el fin de impulsar la investigación y los programas de mejoramiento. Estas matrices contienen marcadores genéticos y anotaciones proporcionados por el cliente original que las diseñó y, por lo tanto, Affymetrix no las actualiza de la misma manera que otros productos del catálogo. A través de este programa, Affymetrix proporciona continuamente a los investigadores en agrigenómica acceso a matrices de genotipado que han sido utilizadas por sus colegas en la comunidad investigadora.
Productos necesarios: Suite de análisis Axiom, Software de consola de comandos GeneChip, Instrumento multicanal GeneTitan, Para uso con (aplicación): Análisis de microarrays
Cantidad: 1 plato
Matriz: Genotipado
Formato: Placa de 96 matrices
Número de matrices: 96 matrices
Especie: Maíz
Tamaño de la unidad: 1 plato