Thermo Fisher, 550879, Matriz de genotipado Axiom™ BreedWheat 35K (formato mini-96)

Matriz de Genotipado Axiom™ BreedWheat 35K (formato mini-96). La Matriz de Genotipado Axiom BreedWheat 35K (Axiom TaBW35K) se diseñó en el marco del Proyecto BreedWheat, en colaboración con el Dr. Etienne Paux, líder del proyecto en el Instituto Nacional de Investigación Agrícola de Clermont-Ferrand, Francia. El Proyecto BreedWheat, una colaboración público-privada francesa, tiene como objetivo fortalecer la competitividad del sector francés de mejoramiento de trigo, así como satisfacer las demandas sociales de sostenibilidad, calidad y seguridad en la producción agrícola. Esta matriz también está disponible en formato 384.
Los 34.746 SNP de esta matriz se derivaron de la matriz de genotipado Axiom TaBW280K (1). Se aplicaron diversos criterios de selección, como perfiles de agrupamiento, distribución uniforme (basada en datos de desequilibrio de ligamiento en lugar de posiciones físicas) y posición conocida en el IWGSC RefSeq v1.
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También se proporciona información sobre los SNP, incluidas posiciones físicas y genéticas, secuencias de contexto y estadísticas derivadas de un panel de 96 líneas de trigo representativas de la diversidad mundial.
Productos necesarios: Software de consola de comandos GeneChip, instrumento multicanal GeneTitan, software Axiom Analysis Suite. Referencia: 1. Rimbert H, Darrier B, Navarro J, Kitt J, Choulet F, et al. (2018) Descubrimiento y genotipado de SNP de alto rendimiento en trigo hexaploide. PLOS ONE 13(1): e0186329.
2. Lange TM, Heinrich F, Enders M, Wolf M, Schmitt AO. (2020) Evaluación in silico de la calidad de SNP: un estudio de caso sobre las matrices de genotipado de trigo Axiom. Current Plant Biology 21:100140.
Cantidad: 1 plato
Formato: Mini placa de 96 matrices
Tamaño de la unidad: 1 plato