Thermo Fisher, 551135, Matriz de genotipado de eucalipto Axiom™ (Axiom Euc72K), formato mini 96

Matriz de Genotipado de Eucalipto Axiom™ (Axiom Euc72K), formato mini 96. La Matriz de Genotipado de Eucalipto Axiom (Axiom Euc72K) es un componente de nuestra Solución de Genotipado Axiom, que prepara y procesa el ADN genómico diana en el instrumento multicanal GeneTitan. El proceso automatizado incluye la hibridación del ADN genómico con esta micromatriz de alto rendimiento, seguida de la tinción, el lavado, la obtención de imágenes y la generación de datos de genotipado de SNP para su posterior análisis. La Matriz de Genotipado de Eucalipto Axiom fue diseñada en colaboración con los Dres. Dario Grattapaglia y Orzenil Bonfim Silva-Junior de EMBRAPA Recursos Genéticos y Biotecnología en Brasil, como parte de la Iniciativa de Matriz de SNP de Eucalipto (ESAI). El objetivo del ESAI fue proporcionar a la comunidad una matriz de genotipado mejorada de baja densidad, con mayor aplicabilidad y un coste significativamente menor para la selección genómica operativa. Esta matriz también está disponible en formato 384HT (n.º de cat. 551134).
Contenido de la matriz de genotipado de eucalipto Axiom (Axiom Euc72K)
• Contiene 72.000 SNP
• Genomas de 240 árboles de 12 especies de eucalipto y una de Corymbia secuenciados en 3.
Cobertura 5X a nivel de árbol individual para desarrollar una colección de 47 millones de variantes de SNP sin procesar
• Datos suplementarios de secuenciación del genoma completo de dos especies de eucalipto subtropical y Corymbia utilizados para aumentar la cobertura de secuencias y la representación de un descubrimiento y selección de SNP mejorados.
• Datos de la secuencia del genoma del ADN del cloroplasto completo utilizados para derivar un subconjunto de SNP de cpDNA
• Listado final de 1.
3 millones de SNP seleccionados para detección según la cobertura física de Eucalyptus grandis versión 2.
0 genoma y examinado con 960 muestras que cubren la gran mayoría del germoplasma de eucalipto plantado en todo el mundo, incluidas 18 especies de eucalipto y 4 de Corymbia
• El análisis dio como resultado una base de datos de >780.000 SNP validados para eucalipto y 30.000 para Corymbia.
• 72 000 SNP seleccionados para una matriz de producción de alto rendimiento basada en la cobertura del genoma y el mejor compromiso para incluir el mayor número de SNP informativos para las especies de eucalipto 'Big Nine' y las periféricas examinadas, al tiempo que se contemplan los SNP para una portabilidad máxima con la matriz de genotipado de SNP de eucalipto anteriorAplicaciones
• Estudios de asociación de todo el genoma
• Mejoramiento molecular (mapeo de asociaciones y selección genómica)
• Creación de una matriz personalizada seleccionando SNP de esta matriz (se ha demostrado que cada SNP elegido tiene un buen rendimiento) Productos necesarios Software de consola de comandos GeneChip Instrumento multicanal GeneTitan Software Axiom Analysis Suite Herramienta de exportación de formato largo Axiom (AxLE) Cantidad: 1 matriz
Condición de envío: Temperatura ambiente
Matriz: Genotipado
Formato: Mini placa de 96 matrices
Número de matrices: 96 matrices
Especie: Eucalipto
Tamaño de la unidad: 1 matriz