Thermo Fisher, 551367, matriz de genotipado Axiom™ OVSNP60, formato 384HT

Matriz de genotipado Axiom™ OVSNP60, formato 384HT. La matriz de genotipado Axiom OVSNP60, formato 384HT, contiene 72.723 SNP identificados en venados de cola blanca en libertad y forma parte de nuestra solución de genotipado Axiom Agrigenomics, donde el ADN genómico objetivo se prepara y procesa en el instrumento multicanal GeneTitan. El proceso automatizado incluye la hibridación del ADN genómico con esta micromatriz de alto rendimiento, seguida de tinción, lavado, obtención de imágenes y la generación de los datos de genotipado para su posterior análisis.
El conjunto de genotipado Axiom OVSNP60 se diseñó con la colaboración del Departamento de Recursos Naturales de Michigan, la Universidad Estatal de Iowa, la Universidad de Wisconsin-Milwaukee, el Instituto de Investigación de Vida Silvestre Caesar Kleberg de la Universidad Texas A&M-Kingsville y el Centro Nacional de Salud de la Vida Silvestre del USGS. El desarrollo de este conjunto contó con el apoyo de una subvención de la Iniciativa Conjunta sobre Enfermedades de la Vida Silvestre del Departamento de Recursos Naturales de Michigan y la Universidad Estatal de Michigan, y de un programa de apoyo a la investigación de enfermedades de la fauna silvestre de EE. UU.
Subvención para conservación multiestatal del Servicio de Pesca y Vida Silvestre de EE. UU.
El uso de esta matriz de densidad media permite que los datos generados en diferentes laboratorios se comparen más fácilmente que los datos generados por otros marcadores (p. ej.
p. ej., microsatélites), lo que facilita la colaboración entre laboratorios.
La matriz de genotipado Axiom OVSNP60 también está disponible en formato 96 (n.º de cat. 551189) y contiene conjuntos de sondas para 702 183 SNP.
Contenido de la matriz
• Conjuntos de sondas para 72.723 SNP identificados en venados de cola blanca, seleccionados después de la evaluación de 702.183 SNP en la matriz de genotipado Axiom OVSNP600 (formato 96) utilizando venados en libertad de 15 estados en el área de distribución oriental de la especie, y también seleccionados en función de su inclusión en la categoría Mejor y Recomendado para obtener resultados de la más alta calidad y distribuidos de manera uniforme en los andamios del genoma de referencia del venado (PRJNA317745)
• Incluye 54 SNP identificados como potencialmente asociados con la susceptibilidad a la CWD en ciervos de cola blanca cautivos. Aplicaciones
• Asignar paternidad y resolver relaciones entre individuos
• Asignar individuos a la población de origen y cuantificar la hibridación
• Distinguir los ciervos cautivos de los ciervos en libertad.
• Realizar estudios genómicos del paisaje para identificar características del paisaje que facilitan o limitan el movimiento de los ciervos/la conectividad de la población.
• Obtener genotipos para SNP previamente asociados con susceptibilidad a CWD y cuantificar la frecuencia y distribución de estas variantes asociadas a CWD en poblaciones. Productos requeridos: Software GeneChip Command Console, instrumento multicanal GeneTitan, software Axiom Analysis Suite, herramienta de exportación de formato largo Axiom (AxLE), cantidad: 384 matrices
Tipo: Matriz de genotipado
Matriz: Genotipado
Formato: Placa de matriz 384
Número de matrices: 384 matrices
Especie: Venado de cola blanca
Tamaño de la unidad: 384 matrices