Thermo Fisher, A25643, Panel de identidad Precision ID

Panel de Identidad Precision ID. El Panel de Identidad Precision ID de Applied Biosystems es una de las primeras soluciones de secuenciación de nueva generación (NGS) para la identificación humana, que identifica de forma única muestras prístinas o degradadas. El panel multiplexado de SNP permite la discriminación de individuos de forma similar a las probabilidades de coincidencia de genotipos STR utilizadas por los analistas forenses (entre 1x10⁻³ y 6x10⁻³).
Se logra un alto poder de discriminación mediante el uso de 34 SNP del clado Y superior y 90 SNP autosómicos que tienen alta heterocigosidad y bajo índice de fijación (Fst), como se describe en publicaciones del Dr. Kenneth Kidd de la Universidad de Yale y el Consorcio SNPForID (1-3). El diseño del panel se ha optimizado para su uso con muestras forenses degradadas o desafiantes utilizando solo 1 ng de entrada de ADN inicial, aunque se ha observado un rendimiento aceptable con cantidades de entrada de sub-nanogramos tan bajas como 100 pg. Los marcadores autosómicos tienen una longitud promedio de amplicón de 132 nucleótidos y los marcadores Y tienen una longitud promedio de 141 nucleótidos. Usando una pequeña entrada de muestra de tan solo 1 ng de ADN, puede pasar de la extracción de la muestra a los genotipos en menos de dos días utilizando el sistema Precision ID NGS y el software Converge para el análisis.
Sencillez
• Los amplicones pequeños permiten una mejor recuperación con muestras degradadas
• Tan sólo 100 pg de entrada
• Preparación automatizada de bibliotecas y plantillas mediante el sistema Ion ChefEscalabilidad
• Múltiples formatos de chip para satisfacer una variedad de requisitos de rendimiento de muestras
• Capacidad de multiplexar hasta 384 muestras*Velocidad
• Menos de 45 minutos de tiempo práctico para un flujo de trabajo de secuenciación dirigida de ADN a datos*
• Tiempo total de obtención de datos inferior a 2 días.* NOTA: El panel de identidad Precision ID proporciona material suficiente para realizar 96 reacciones con el kit manual de la biblioteca Precision ID (n.° de cat. A26435) o 32 reacciones con el kit automatizado de la biblioteca Precision ID DL8 (n.° de cat. A33212).* Uso del sistema NGS Precision ID para la identificación humana. Referencias: 1. Pakstis, AJ, Speed, WC, Fang, R, Hyland, FC, Furtado, MR, Kidd, JR y Kidd, KK. (2010) SNPs para un panel universal de identificación individual. Human Genetics 127(3), 315-324.
2. Phillips, C, Fang, R, Ballard, D, Fondevila, M, Harrison, C, Hyland, F, et al. (2007) Evaluación del sistema de tipificación de SNP Genplex y un panel de marcadores forenses 49plex. Forensic Science International: Genetics 1(2), 180-185.
3. Karafet, TM, Mendez, FL, Meilerman, MB, Underhill, PA, Zegura, SL y Hammer, MF. (2008) Nuevos polimorfismos binarios remodelan y aumentan la resolución del árbol de haplogrupos del cromosoma Y humano. Genome Research 18(5), 830-838.
Tipo de producto final: amplicones de PCR
Para usar con (aplicación): secuenciación
Para usar con (equipo): Sistema Ion GeneStudio S5, Sistema Ion PGM™, Sistema Ion S5™ XL, Sistema Ion OneTouch™ 2, Sistema Ion Chef™
Bibliotecas: Biblioteca de secuenciación dirigida
Número de reacciones: 96 reacciones
Línea de productos: Ion AmpliSeq™, Ion Torrent™
Tipo de producto: Panel de identidad Precision ID
Cantidad: 96 reacciones
Tipo de muestra: ADN
Especie: Humana
Paso del flujo de trabajo: Generación de biblioteca
Tipo de secuenciación: secuenciación del genoma y del ADN
Tamaño de la unidad: cada una