Thermo Fisher, A31149, Ensayo de ADNc pulmonar Oncomine™

Ensayo Oncomine™ Lung cfDNA El ensayo Oncomine™ Lung cfDNA forma parte de una solución de investigación completa para detectar ADN derivado de tumores pulmonares (ctDNA) en cfDNA. Proporciona los reactivos para la construcción de bibliotecas y un único pool de cebadores de PCR multiplex para la preparación de bibliotecas de amplicones a partir de ADN libre de células (cfDNA) obtenido de la fracción plasmática de un único tubo de sangre completa. El ensayo permite a los investigadores analizar variantes de un solo nucleótido e indeles cortos que mutan con frecuencia en el cáncer de pulmón de células no pequeñas (CPCNP). Se cubren once genes y >150 puntos calientes (genes: ALK, BRAF, EGFR, ERBB2, KRAS, MAP2K1, MET, NRAS, PIK3CA, ROS1 y TP53). Mediante el uso de tecnología de secuenciación patentada, se puede lograr un límite de detección (LOD) de hasta el 0,1 %. Nota: Los archivos BED de destino y punto de acceso y el documento de la Guía del usuario para el análisis de variantes de cfDNA con el software Torrent Suite 5.2 se pueden encontrar a continuación en 'Documentos'.
• Diseño de amplicón optimizado para cfDNA corto (∼170 pb)
• Detección de variantes de un solo nucleótido (SNV) e indeles cortos hasta 0,1 % LOD
• El diseño optimizado del ensayo dirigido permite una secuenciación de próxima generación (NGS) altamente multiplexada, lo que reduce los costos de secuenciación.
• Sensibilidad y especificidad muy altas, lo que permite niveles de detección extremadamente bajos con un mínimo de falsos positivos.
Flujo de trabajo eficiente, desde un solo tubo de sangre hasta resultados en tan solo 2 días. ¿Por qué los patólogos y oncólogos se interesan en la investigación clínica del cáncer mediante biopsia líquida? Las biopsias líquidas ofrecen varias ventajas sobre las muestras convencionales de tumores sólidos:
• Es menos invasivo de obtener, lo que permite tomar muestras del contenido del tumor varias veces.
• Menor costo en comparación con las muestras de tejido tradicionales
• Tiempo de respuesta más rápido desde la muestra hasta los resultados.
• Ayuda a capturar más de la heterogeneidad del tumor.
• Puede conducir a mejoras en el estándar de atención en el futuro. Todo el flujo de trabajo (figura a continuación), desde el aislamiento de cfDNA utilizando el kit de aislamiento de ADN libre de células MagMAX™ hasta el análisis de las muestras, se puede lograr en solo 2 días utilizando el sistema Ion Chef™ y el sistema de secuenciación Ion S5™ XL. A diferencia de otras tecnologías con LOD bajos (1-5%), el ensayo Oncomine Lung cfDNA tiene un límite de detección flexible de hasta 0.1% o 1 copia mutante en un fondo de 1000 copias de tipo salvaje. Para lograr 0.1% LOD, se requieren 20 ng de cfDNA de entrada. Se pueden utilizar cantidades menores de cfDNA, pero el LOD resultante será mayor dependiendo de la cantidad de entrada. Simplicidad, velocidad y escalabilidad. El ensayo Oncomine Lung cfDNA permite estudios genéticos del cáncer desde tan solo 1 ng de cfDNA de entrada para la construcción de bibliotecas dirigidas. El ensayo de cfDNA utiliza equipo de PCR estándar y dos reacciones de PCR sencillas: una para la secuenciación y la segunda para amplificar la biblioteca para la selección de dianas mediante PCR multiplex de alta resolución, lo que minimiza la necesidad de una gran inversión de capital. Además, el ensayo de cfDNA pulmonar Oncomine es compatible con muestras FFPE para posibles estudios de concordancia. El tiempo total para obtener las bibliotecas diana suele ser de tan solo 3,5 horas. La escalabilidad y la flexibilidad se consiguen utilizando el conjunto de códigos de barras de secuenciación de etiquetas 1-24. Para usar con (aplicación): Secuenciación.
Para usar con (equipo): Sistema Ion GeneStudio S5, Sistema Ion PGM™, Sistema Ion S5™ XL
Bibliotecas: Biblioteca de secuenciación dirigida
Número de reacciones: 8
Línea de productos: Oncomine™
Tipo de producto: Ensayo de cfDNA
Cantidad: 8 Reacciones
Tipo de muestra: cfDNA
Condición de envío: Hielo seco
Paso del flujo de trabajo: Construcción de la biblioteca con panel
Tipo de secuenciación: secuenciación de ADN libre de células (cfDNA)
Tamaño de la unidad: cada una