Kit de biblioteca HTS AgriSeq™ de Thermo Fisher, A34144

El kit de bibliotecas AgriSeq HTS de Applied Biosystems (960 reacciones) está diseñado específicamente para la preparación de alto rendimiento de bibliotecas de amplicones para aplicaciones específicas de genotipado por secuenciación (GBS) en agrigenómica. Sus principales características incluyen:
• La uniformidad excepcional de la amplificación del objetivo multiplexado genera resultados robustos y reproducibles.
• El flujo de trabajo simplificado permite un procesamiento de muestras de alto rendimiento
• La configuración conveniente contiene reactivos de normalización de bibliotecas y volúmenes suficientes para plataformas automatizadas. Excelente calidad de datos. La preparación de bibliotecas AgriSeq se ha optimizado para GBS objetivo de paneles que van desde 100 hasta 5000 amplicones. Con una tecnología multiplex altamente eficiente y específica, la amplificación AgriSeq puede generar bibliotecas con alta uniformidad (87,2-99,3%), porcentaje de lecturas en el objetivo (85,7-99,7%) y tasas generales de llamada de genotipo (87,5-99,7%) basadas en un conjunto de nueve paneles recientemente diseñados que varían en tamaño desde 62-3000 amplicones a través de siete especies diferentes. La figura a continuación muestra un promedio de 98,2% de uniformidad para un panel de 3000 amplicones a través de 192 muestras (es decir, el 98% de las bases están cubiertas por al menos 0,2X de la profundidad de lectura promedio). Una cobertura uniforme es significativa, ya que reduce la cantidad de secuenciación necesaria para lograr llamadas de genotipo consistentes, lo que reduce el costo de secuenciación por muestra. En comparación, se informa un rendimiento de multiplexación más débil con la tecnología de la competencia TruSeq, que proporciona solo un 88% de uniformidad promedio y una capacidad de multiplexación máxima reportada de 1536 (ver referencia). Procesamiento de muestras de alto rendimiento. El flujo de trabajo de la biblioteca AgriSeq (ver figura a continuación) se puede realizar en placas de 96 o 384 pocillos para el procesamiento de muestras de alto rendimiento utilizando tan solo 10 ng de entrada de ADN por reacción. El flujo de trabajo se ha optimizado para minimizar la manipulación de muestras y el uso de reactivos auxiliares mediante el procesamiento de muestras agrupadas. Esto permite que el flujo de trabajo se complete con pasos de pipeteo mínimos, lo que ayuda a reducir el potencial de error y simplifica la configuración de la automatización en plataformas comunes de terceros como los sistemas Tecan o Hamilton. El procesamiento estándar del análisis de datos incluye la evaluación automatizada de la calidad, la alineación y la determinación de genotipos mediante el software Torrent Suite y el complemento Variant Caller, sin necesidad de bioinformático, almacenamiento de datos costoso ni programas de terceros. El kit AgriSeq HTS, con un práctico empaque que incluye reactivos y volúmenes de normalización de bibliotecas para la automatización, se ofrece en paquetes grandes (960 o 9600 reacciones) para proyectos de agrigenómica de alto rendimiento, minimizando el coste y el desperdicio de embalajes innecesarios. El kit AgriSeq HTS incluye no solo los reactivos para la preparación de bibliotecas, sino también todos los componentes necesarios para la normalización de bibliotecas, lo que ayuda a obtener resultados consistentes entre muestras. Además, se ha proporcionado suficiente excedente para facilitar los flujos de trabajo automatizados. Con un bajo precio por muestra, disponible exclusivamente para clientes agrícolas, AgriSeq HTS es una forma económica de generar datos de genotipado de alto rendimiento para impulsar sus programas de mejoramiento genético. Formato: Kit.
Tipo de muestra: ADN
Tipo de secuenciación: secuenciación del genoma y del ADN
Para usar con (equipo): Sistema Ion GeneStudio S5
Para usar con (aplicación): secuenciación
Bibliotecas: Biblioteca de secuenciación dirigida
Número de reacciones: 960 reacciones
Línea de productos: AgriSeq™
Tipo de producto: Kit de biblioteca HTS
Cantidad: 960 reacciones
Condición de envío: Aprobado para envío a temperatura ambiente o en hielo húmedo o seco.
Paso del flujo de trabajo: Generación de biblioteca
Tamaño de la unidad: cada una