Thermo Fisher, A40938, Estándar de digestión de levadura Pierce™ TMT11plex

20 μg. El estándar de digestión de levadura Pierce TMT11plex consta de cuatro cepas congénicas de Saccharomyces cerevisiae (una línea parental, BY4741, y tres líneas que carecen de las proteínas no esenciales Met6, His4 o Ura2) marcadas por triplicado (cepas knock-out) o por duplicado (cepa parental) con reactivos de marcaje TMT11-plex. Las cepas knock-out se utilizan en combinación con la cepa parental para comparar la abundancia de péptidos y proteínas para su cuantificación. Estándar de digestión de levadura Pierce TMT11plex:
• Conveniente: polvo liofilizado listo para usar, preetiquetado con reactivos TMT11plex
•Calidad: cepas de levadura verificadas en cuanto a genotipo, mezcla equimolar de las cepas marcadas con TMT
•Cuantitativo: mide la precisión cuantitativa de los iones reporteros TMT para 11 canales
Diagnóstico: excelente herramienta de control de calidad para la cuantificación de proteínas mediante TMT en instrumentos LC-MS/MS. Las estrategias proteómicas cuantitativas con reactivos TMT permiten la multiplexación y la medición precisa de la abundancia de proteínas. La correcta cuantificación de TMT incluye cromatografía, espectrometría de masas (MS) y análisis de datos optimizados. Un parámetro crucial para el éxito de este flujo de trabajo es la capacidad de detectar consistentemente iones de fragmentos de TMT en 11 canales para la multiplexación. Nuestro estándar TMT11plex Yeast Digest ha sido diseñado específicamente para evaluar el rendimiento del sistema LC-MS/MS para la cuantificación de TMT, la optimización de métodos MS y la validación del sistema. Para el desarrollo de métodos, el estándar TMT11plex Yeast Digest permite medir la exactitud, la precisión y el rango dinámico de diferentes enfoques de espectrometría de masas. Estos estándares pueden ayudar a optimizar el fraccionamiento fuera de línea, la cromatografía, la adquisición de espectrometría de masas y la configuración del análisis de datos. Las aplicaciones multifuncionales que utilizan este estándar reducen la variabilidad interexperimental para proporcionar una cuantificación de TMT reproducible.
Referencias: 1. Paulo JA, O'Connell JD, Gygi SP. Un estándar proteómico de triple knockout (TKO) para el diagnóstico de interferencia iónica en experimentos de marcaje isobárico. J Am Soc Mass Spectrom. 2016 10:1620-5.
2. Yang F, Shen Y, Camp DG 2nd, Smith RD. Cromatografía de fase reversa a pH alto con concatenación de fracciones para análisis proteómico 2D. Expert Rev Proteomics. 2012 9(2):129-34.
3. Dayon L, Pasquarello C, Hoogland C, Sanchez JC, Scherl A. Combinación de espectros de masas en tándem de baja y alta energía para la cuantificación optimizada de péptidos con etiquetas isobáricas. J Proteomics. 2010 73(4):769-77.
4. Diedrich JK, Pinto AF, Yates JR 3.er puesto. Dependencia energética del HCD en la fragmentación de péptidos: la energía de colisión escalonada encuentra el punto óptimo. J Am Soc Mass Spectrom. 2013 24(11):1690-9.
5. Chiva C, Sabidó E. El método de fragmentación con HCD únicamente equilibra la identificación y cuantificación de péptidos en muestras marcadas con TMT en espectrómetros de masas híbridos de trampa de iones lineal/orbitrap. J Proteomics. 2014 96:263-70.
Productos relacionados: Estándar de digestión de proteínas HeLa de Pierce, Mezcla de calibración del tiempo de retención de péptidos de Pierce, Juego de reactivos de etiqueta isobárica TMT10plex más reactivo de etiqueta TMT11-131C. Tipo de producto final: Estándar de MS.
Para uso con (equipo): espectrómetro de masas
Cantidad: 20 μg
Condición de envío: Hielo húmedo
Paso del flujo de trabajo: Rendimiento del sistema MS
Método de detección: espectrometría de masas
Forma: Polvo liofilizado
Línea de productos: Pierce™
Tipo de producto: Digest Standard
Material de partida: Péptidos
Tamaño de la unidad: cada una