Thermo Fisher, A45485, Ensayo Oncomine™ BCR IGH LR, ARN

Ensayo Oncomine™ BCR IGH LR, ARN. El ensayo Ion Torrent Oncomine BCR IGH LR es un ensayo robusto y específico de secuenciación de nueva generación (NGS), diseñado para su uso en hemato-oncología, inmuno-oncología, enfermedades infecciosas e investigación en inmunología básica. A diferencia de otras tecnologías, el ensayo Oncomine BCR IGH-LR ofrece más de 400 amplicones de base de secuenciación de biblioteca mediante química de secuenciación de lectura larga, lo que permite una cobertura completa de la cadena pesada de inmunoglobulina (IGH) del receptor de linfocitos B (BCR). El kit de ensayo incluye un conjunto único de cebadores de PCR multiplex, un kit de síntesis de ADNc y reactivos de biblioteca Ion Ampliseq. El ensayo Oncomine BCR IGH LR está diseñado para medir con precisión la expansión clonal, cuantificar la hipermutación somática y el isotipo de linfocitos B mediante ARN total extraído de médula ósea, sangre completa, leucocitos de sangre periférica (PBL), células mononucleares de sangre periférica (PBMC) o células clasificadas en muestras de investigación congeladas en fresco. El ensayo utiliza la tecnología de PCR multiplex Ion AmpliSeq. Amplifica el marco 1 (FR1) y la región constante del gen BCR IGH para analizar las regiones determinantes de complementariedad CDR1, CDR2 y CDR3, muy diversas, así como el dominio CH1 del gen constante para permitir la distinción de los nueve isotipos. Los motivos de aminoácidos de la región CDR de IGH pueden revelar firmas de respuestas de linfocitos B a antígenos definidos para su uso como futuros marcadores de enfermedades autoinmunes o infecciosas. El análisis automatizado de linaje clonal y la capacidad de análisis multimuestra facilitan el seguimiento de la evolución clonal de células B derivada de la hipermutación somática y la recombinación por cambio de clase en muestras de investigación. Las ventajas del ensayo Oncomine BCR IGH LR incluyen:
• El amplicón extendido permite la cuantificación de la hipermutación somática de genes variables y la identificación de isotipos para posibilitar la investigación clínica y traslacional en hematooncología, inmunooncología y enfermedades infecciosas.
• Los cebadores de ensayo están diseñados para amplificar todos los alelos de genes variables y de unión en la base de datos IMGT, el estándar de oro.
• La entrada de ARN mejora la detección de cambios en las poblaciones de plasmablastos y células plasmáticas en muestras de investigación después del desafío inmunológico o la administración de agentes inmunomoduladores.
• El diseño superior de PCR multiplex a través de la tecnología Ion AmpliSeq garantiza alta precisión y alta sensibilidad
• La tasa de error de sustitución ultrabaja minimiza los artefactos que surgen de los errores de secuenciación para permitir una evaluación altamente precisa de la hipermutación somática y la heterogeneidad clonal en muestras de investigación de células B malignas de interés.
• Todo el flujo de trabajo, desde el aislamiento del ARN hasta el análisis de las muestras, se puede realizar en dos días utilizando el sistema de plantillas Ion Chef y el sistema de secuenciación Ion Genestudio S5.
• Los requisitos de entrada flexibles garantizan la construcción exitosa de una biblioteca con una entrada de ARN total de tan solo 25 ng y hasta 2 μg.
• Esta solución informática optimizada y fácil de usar ofrece clonotipado automatizado, cuantificación de hipermutaciones somáticas, análisis de linaje clonal, generación de informes de características clave del repertorio y capacidad de análisis multimuestra para rastrear clones de células B en muestras de investigación. Más información sobre el ensayo ›Nota: Encontrará información sobre el análisis de datos con el software Ion Reporter v5.12 en la Guía del usuario a continuación. Para usar con (aplicación): Secuenciación.
Bibliotecas: Biblioteca de secuenciación dirigida
Número de reacciones: 24
Línea de productos: Oncomine™
Tipo de producto: Ensayo BCR IGH SR
Tipo de muestra: ARN (Total)
Condición de envío: Aprobado para envío en hielo húmedo o seco
Paso del flujo de trabajo: Generación de biblioteca
Tipo de secuenciación: secuenciación del genoma y del ADN
Tamaño de la unidad: cada una