Thermo Fisher, A48577, Oncomine™ Comprehensive Assay Plus, preparación manual de bibliotecas

Oncomine™ Comprehensive Assay Plus, preparación manual de bibliotecas. Oncomine™ Comprehensive Assay Plus es un ensayo de secuenciación genómica dirigida de nueva generación (NGS) que proporciona una solución integral de perfil genómico, adecuada para tejidos fijados en formalina e incluidos en parafina (FFPE) de tumores sólidos. El ensayo detecta múltiples biomarcadores asociados con terapias dirigidas y de puntos de control inmunitarios para la investigación del cáncer. Permite el análisis simultáneo de ADN y ARN para detectar simultáneamente múltiples tipos de variantes en un único flujo de trabajo, incluyendo variantes de un solo nucleótido (SNV), inserciones y deleciones (InDels), variantes del número de copias (CNV), grandes reordenamientos genómicos (LGR) de BRCA1 y BRCA2, métrica de inestabilidad genómica (GIM), inestabilidad de microsatélites (MSI), carga mutacional tumoral (TMB), pérdida de heterocigosidad (LOH) y fusiones génicas con FusionSync. Las características principales del ensayo incluyen:
• Perfile más de 500 genes únicos para obtener información sobre biomarcadores de un solo gen y de múltiples genes
• Permite el análisis de varias variantes de un solo gen, como SNV, indels, fusiones, variantes de empalme y CNV, incluidas tanto las ganancias como las pérdidas del número de copias.
• Detección de biomarcadores complejos asociados a inmunoterapias como TMB y MSI
• Apoya la investigación de la deficiencia de recombinación homóloga (HRD) mediante la detección de mutaciones en 46 genes HRR, incluidos los LGR BRCA, y la evaluación de la cicatrización genómica con la métrica de inestabilidad genómica (GIM).
• Rendimiento robusto con tan solo 20 ng de ADN/ARN aislados de muestras FFPE, incluidas biopsias con aguja fina
• El contenido impulsado por la base de conocimientos de Oncomine y científicos experimentados ayuda a garantizar la cobertura de objetivos clave alineados con la evidencia publicada.
El flujo de trabajo altamente automatizado y el proceso de análisis bioinformático optimizado para Oncomine Comprehensive Assay Plus ayudan a obtener información valiosa. Oncomine Comprehensive Assay Plus proporciona los reactivos para la construcción de bibliotecas y cuatro grupos (dos de ADN y dos de ARN) de cebadores de PCR multiplex para la preparación de bibliotecas de amplicones a partir de muestras tumorales fijadas en formalina e incluidas en parafina (FFPE). Diseñado para ayudarle a pasar de cientos a unos pocos factores de cáncer relevantes, este ensayo forma parte de un flujo de trabajo integral que permite el análisis de datos de NGS desde tan solo 10 ng de ácido nucleico por grupo. El ensayo está optimizado para la secuenciación en los sistemas Ion GeneStudio S5 con el chip Ion 550 para permitir hasta cuatro muestras y un control sin plantilla (NTC) por ejecución. Al combinarlo con el software Oncomine Reporter, puede centrarse en los factores clave del cáncer en su investigación. De la muestra a la respuesta. El Oncomine Comprehensive Assay Plus forma parte de un flujo de trabajo de NGS que ayuda a los investigadores a filtrar los resultados de variantes, desde cientos hasta solo unas pocas variantes clave de cáncer. Gracias a Oncomine Informatics, este filtrado le ayuda a contextualizar e interpretar los hallazgos para obtener las respuestas que necesita. Más información sobre Oncomine Oncology › Tipo de muestra: ADN, ARN
Tipo de secuenciación: secuenciación de próxima generación
Para usar con (equipo): Sistema Ion GeneStudio™ S5 Prime, Sistema Ion GeneStudio™ S5 Plus, Sistema Ion S5™ XL, Instrumento Ion Chef™
Bibliotecas: Biblioteca de secuenciación dirigida (basada en amplicones)
Línea de productos: Oncomine
Cantidad: 24 muestras
Paso del flujo de trabajo: Generación de biblioteca
Tamaño de la unidad: cada una